Gli altari sono decorati da specchiature in marmo travertino da Rapolano venato con cornici in rosso antico; la fascia sopra la mensa, terminante in volute scolpite, è in calcare rosa corallo. Il piano dell'altare è retto da mensole con volute a forma di foglia. Il paliotto ha un ricco motivo che sporge leggermente con tondo al centro includente croce raggiata in marmi intarsiati. Intorno cornici modanate e volute ad orecchie. Gli altari poggiano su due gradini in marmo. Sull'altare di sinistra è la pala raffigurante San Giuseppe (cfr. scheda: 14/00002087), quello di destra la morte di san Francesco (cfr. scheda: 14/00002099). I due dipinti sono compresi entro cornici in stucco con stemma del Cardinale Stabile