Il restauro degli affreschi iniziò nel 1951 e terminò nel 1955, con alcune riprese successive nel 1958, e venne portato avanti dal pittore e restauratore Arturo Raffaldini (Mantova, 1899 - Firenze,1962) sotto la direzione dello storico dell'arte Cesare Gnudi (Ozzano dell'Emilia, 1910 – Bologna, 1981).  Nato nel 1899 a Mantova, Raffaldini si forma come artista presso l’Accademia di Brera di Milano grazie ad una borsa di studio. Il suo talento artistico è promettente ma il riconoscimento più importante gli verrà ben presto dalla professione di restauratore, che comincerà dopo la guerra a partire dal 1922, quando prende parte agli imponenti lavori di recupero del Palazzo Ducale di Mantova. In questo sito Raffaldini riceverà importanti commissioni che lo consacreranno come autorevole restauratore per gli anni a seguire, prima a Mantova e poi nel resto di Italia. Tra i suoi allievi di maggior successo si annovera anche Ottorino Nonfarmale che, non solamente nell'occasione di Schifanoia, prenderà in mano il lavoro precedente del maestro Raffaldini.