Dell'antica struttura portuale di S. Marco si conservano attualmente i resti di due moli: uno con andamento nord-sud , completamente sommerso ed uno con andamento est-ovest, in parte affiorante. Il primo tratto, in pessimo stato di conservazione, si presenta come un insieme di pietre di calcarenite locale disperse su una vasta area insieme ad alcuni blocchi di cementizio in posizione di crollo; per la costruzione della struttura fu dapprima realizzata una massicciata in pietre per ridurre la profondità  ed in seguito il molo, costruito con gettata entro cassaforma. Il secondo molo si conserva per una lunghezza complessiva di circa 80 m ed è stato realizzato, in opera cementizia gettata entro cassaforme lignee di cui sono ancora visibili, a cadenza regolare, i fori lasciati dalle travature e dai pali verticali infissi direttamente nel banco roccioso sottostante