Nell’area di un attuale piccolo edificio sconsacrato intitolato alla Santa Croce, sorgeva in antico una chiesa, fatta erigere nella prima metà del V secolo da Galla Placidia (secondo quanto tramandato dal protostorico Andrea Agnello), della quale il Mausoleo costituiva un'appendice collegata anche dal punto di vista strutturale. Indagini archeologiche effettuate a più riprese hanno messo in evidenza che in una zona prima occupata da una domus romana e poi abbandonata, venne impostato un edificio a croce latina affiancato da portici colonnati e pavimentati a mosaico policromo. La chiesa ha avuto varie fasi d’uso e di recupero edilizio, per essere poi definitivamente dismessa nel XIV secolo.