l'Orto Botanico è sviluppato intorno ad un percorso principale longitudinale, in piano, ed uno trasversale che risale il rilevo. Le specie botaniche sono organizzate per blocchi rettangolari suddivisi da percorsi secondari. Una scalinata realizzata nel dopoguerra collega il percorso principale con l'Istituto di Botanica situato in cima al rilievo. Nell’area dell’Orto sono presenti rilevanti testimonianze romane: la cava punico romana, un sistema di cisterne, un Calidarium e un pozzo, il "libarium”, conosciuto come Fontana di Palabanda. E’ presente inoltre un Museo-erbario importante che è stato censito per le sue potenzialità ed il suo patrimonio nell'Index Herbariorum.