La figura di San Giovanni Battista esibisce i caratteri e gli attributi iconografici tradizionali, compresi la veste da eremita e il sacro vessillo, la croce astile dotata del cartiglio con la scritta "Ecce Angnus Dei".La scelta del formato a mezzo busto, collocato all'interno di uno spazio occupato completamente e saturato dalla figura, amplifica la carica intensamente espressiva dell'opera, alla quale l'Agostinelli Tozzi nel 1951 attribuì una qualità piuttosto modesta, rispetto ai pannelli con la Madonna e San Bernardino, mentre il Carli nel 1979 rese giustizia all'opera accomunandola agli altri elementi in un giudizio di qualità piuttosto alta.Notevole la carica trasmessa dallo sguardo tristemente penetrante del protagonista, accentuato dal garbo dei chiaroscuri e dal classico gesto della mano indicante il vessillo che, però, in questa fattispecie esalta il contrasto tra l'incidenza intensa della luce, proveniente da sinistra e che si diffonde sull'avambraccio destro, e la tenebra che progressivamente invade il lato destro della composizione, con soluzioni chiaroscurali molto intense.L'Huym notò le notevoli tonalità bronzate nel trattamento della pelle d'animale che riveste il corpo del santo, in un singolare scelta cromatica di particolare ricchezza e che lo studioso accomunò