La decorazione dipinta dell'ancona è una realizzazione imponente in quanto ciascun intaglio è accuratamente dipinto. Le vesti dei personaggi sono inoltre tutte decorate da finissimi motivi in oro: nello sfondo dei pannelli scolpiti (Natività; Fuga in Egitto; Pentecoste) sono dipinti paesaggi ravvivati da lumeggiature in oro, come in una miniatura. Il maggior impegno decorativo si dispiega però nelle tre scene della predella, che si svolgono in interni architettonici: in esse le membrature architettoniche sono adorne di fregi decorativi e di raffinate grottesche con minuscole figurine mitologiche e fantastiche, in vivacissimo movimento; nel pannello centrale con lo Sposalizio della Vergine inoltre vi sono alcune scene figurate, realizzate a monocromo, come finti affreschi: nella lunetta di fondo dell'abside vi è il Sacrificio di Isacco; nelle lunette dell'arco trionfale sono due figure di angeli; sull'alto cornicione mediano della navata centrale, ai lati di un oculo, sono le due scene del Peccato originale e della Cacciata dal paradiso