Il soggetto riprende l'iconografia tradizionale del santo inginocchiato che riceve le stimmate da un Cristo alato. Francesco è rappresentato in primo piano, su di uno sperone roccioso reso con larghe e pastose pennellate; il volto espressivo e provato è incorniciato dal cappuccio del saio che ne ombreggia una parte creando ub effetto di chiaroscuro che accentua lo sguardo sostenuto da una particolare tensione spirituale. Appena arretrato il Cristo appare diafano e avvolto da un trbine di nubi. E'cinto in vita da un perizoma bianco drappeggiato e due grosse ali ne sostengono l'intera figura