Accanto alla chiesa si delinea il blocco rettangolare del convento. Il prospetto che volge verso l'isola è arricchito dalla scansione regolare delle finestre. Superate le bianche volte a crociera dell'ingresso, imponenti per ritmo solenne con cui si susseguono i pilastri e gli archi, si giunge, attraverso strette scalette, ai tre piani ove, sull'ampio corridoio collocato verso settentrione si aprono le modeste cellette con l'intento di lasciare l'esposizione più confortevole agli ambienti dormitorio. Nel sottosuolo del convento si conserva l'ossario delle suore: piccoli ambienti circondati dagli impressionanti scolatoi, ove sì deponevano i cadaveri per farli essiccare